Sus otras novelas incluyen:
* El ciclo de la puerta de la muerte (1990-1994)
* El Libro de la Tierra Negra (1995)
* El libro de la rosa blanca (1996)
* El libro del sol rojo (1997)
* El vacío (2000)
* La Esfera (2001)
* El horizonte (2002)
* El velo (2003)
* La división (2005)
* El anillo (2007)
* El muro (2008)
Sus cuentos incluyen:
* "El último de los Winnebago" (1987)
* "La forma de las cosas" (1989)
* "La luna del cazador" (1991)
* "La sombra de la tormenta" (1992)
* "El pozo de las tinieblas" (1993)
* "La perdición de Dragonstar" (1994)
* "El destino de los dioses" (1995)
* "El fin de la eternidad" (1996)
* "El día que la Tierra se detuvo" (1997)
* "La última pregunta" (1998)
Sus colecciones incluyen:
* *William E. Waters:En la balanza* (1991)
* *William E. Waters:El último de los Winnebagoes y otras historias* (1993)
* *William E. Waters:La forma de las cosas y otras historias* (1995)
* *William E. Waters:La luna del cazador y otras historias* (1997)
* *William E. Waters:La sombra de la tormenta y otras historias* (1999)
Waters también ha escrito varios libros para adultos jóvenes, entre ellos:
* Las tierras perdidas (2000-2003)
* La sombra de los dioses (2005)
* El último de los elfos (2007)
* El ascenso del Señor Oscuro (2009)
* La batalla de titanes (2011)
* El amanecer de los antiguos (2013)
* La caída de la Atlántida (2015)
Waters ha ganado numerosos premios por su trabajo, incluido el World Fantasy Award. a Mejor Novela para La ira de Tiamat y el Premio Locus a la Mejor Novela Fantástica para El fragmento de cristal . Es miembro de la Asociación de Escritores de Ciencia Ficción y Fantasía de Estados Unidos y de la Asociación de Escritores de Terror.