- Coma, beba y sea saludable:Guía para una alimentación saludable de la Facultad de Medicina de Harvard (2001)
- Epidemiología nutricional, 3.ª edición (2013) (coeditado con Meir Stampfer)
- Epidemiología nutricional de Willett, segunda edición (2018) (editado por Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:Cómo nos engancharon los gigantes de la comida (2020) (en coautoría con Marion Nestle)
Además de estos libros, Walter Willett ha publicado artículos científicos, reseñas y recomendaciones de políticas en varias revistas médicas y nutricionales.