- _Recuerdos de una visita a Filipinas en el año 1853_ (1853)
- _El archipiélago malayo:la tierra del orangután y el ave del paraíso. Una narrativa de viajes, 1848-1862_ (2 vols., 1869)
- _Diario y Actas en el Estrecho de Corea_ (1869)
- _Borneo y el archipiélago indio_ (1870)
- _Los viajes y aventuras de Fernando Méndez Pinto, el portugués_ (1880)
- _Viejo Penang_ (1911)
- _La Historia del Archipiélago Indio_ (1911)
- _Narrativa de la misión del conde de Elgin a China y Japón en los años 1857, '58, '59_ (1912)
- _Reminiscencias de viajes por el Lejano Oriente_ (1913)
Artículos:
- "Avisos de gramática china" (_The Chinese Repository_, 1847)
- "Etiqueta y costumbres chinas" (_The Chinese Repository_, 1847)
- "La Religión de China" (_El Repositorio Chino_, 1847)
- "Las piraterías malayas" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1847)
- "Avisos del archipiélago indio y la etnología malaya" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1850)
- "Los chinos en Borneo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1850)
- "Los Bataks de Sumatra" (_El Diario del Archipiélago Indio y Asia Oriental_, 1851)
- "Algunos relatos de los Banting Muruts" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1852)
- "Las aves del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1852)
- "La Mammalia del Archipiélago Malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Los reptiles del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Los peces del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Los insectos del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Las plantas del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1854)
- "La geología del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1855)
- "El clima del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1856)
- "La geografía física del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1857)
- "La etnología del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1858)
- "La Historia del Archipiélago Malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1859)
- "La literatura del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1860)
- "Las artes y las ciencias del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1861)
- "El comercio del archipiélago malayo" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1862)