Ella deja el grupo al final de la saga Johto (alrededor del final del anime Pokémon Oro y Plata) y no reaparece hasta el comienzo de la saga Sinnoh (alrededor del comienzo del anime Pokémon Diamante y Perla).
Si bien hay algunos casos en los que Misty aparece en el anime de Hoenn en flashbacks o menciones, ella nunca visita físicamente la región en la historia principal.