Durante el juego, las cartas se pueden descartar por varios motivos, como por ejemplo:
- Jugar ciertas cartas de entrenador y Pokémon que requieren que se descarten otras cartas como costo.
- Descartar como resultado de ciertos ataques, habilidades o efectos
- Descartar voluntariamente cartas de la mano para robar cartas del mazo al final del turno.
- Penalización por infringir ciertas reglas del juego, como intentar jugar demasiadas energías básicas en el mismo turno.