Sonic X terminó con su tercera temporada en 2006. Si bien ha habido algunos rumores y deseos de los fanáticos de una continuación, no hay planes ni anuncios oficiales de Sega ni de los creadores para una cuarta temporada.
La tercera temporada concluyó el arco argumental principal de Sonic X, en el que los héroes regresaron a sus propias dimensiones después de una larga aventura.
Vale la pena señalar que la serie ha tenido cierta "continuación" en la forma del manga Sonic X. y cómic de Sonic X que presentaba historias y personajes adicionales. Sin embargo, estos están separados del programa de televisión.