Esta dificultad es la más fácil del juego y generalmente se considera más indulgente que los otros niveles de dificultad. Los enemigos son menos agresivos y tienen menos salud, y el juego le da al jugador más vidas y continúa.
Difícil:esta dificultad es más desafiante que la normal, pero aún así es relativamente indulgente. Los enemigos son más agresivos y tienen más salud, y el juego le da al jugador menos vidas y continúa.
Muy difícil:este es el nivel de dificultad más desafiante del juego y es muy implacable. Los enemigos son extremadamente agresivos y tienen mucha salud, y el juego le da al jugador muy pocas vidas y continúa. Esta dificultad no se recomienda para principiantes o jugadores ocasionales.
Además de los tres niveles de dificultad principales, también hay una serie de dificultades secretas que se pueden desbloquear en el juego. Estas dificultades secretas son incluso más desafiantes que la dificultad Muy Difícil y no se recomiendan para nadie excepto para los jugadores más experimentados de Sonic Heroes.