A lo largo de la canción, Tankian pinta un cuadro vívido de aislamiento emocional, donde los individuos están atrapados en sus realidades separadas, incapaces de alcanzarse o entenderse verdaderamente unos a otros. Utiliza imágenes de espacios físicos, como casas vacías y paisajes áridos, para reflejar el vacío que se siente en su interior.
Además, contempla el impacto de la tecnología y las conexiones superficiales, destacando cómo a pesar de vivir en una era de comunicación constante, sigue habiendo un vacío en las interacciones humanas.
En última instancia, "Empty Walls" es un llamado a conexiones más profundas y genuinas, una expresión del deseo de liberarse de los muros emocionales que separan a las personas y abrazar una experiencia humana más satisfactoria. Sirve como un poderoso recordatorio de la importancia de fomentar relaciones significativas y nutrir el aspecto emocional de nuestras vidas.