En Pokémon Cristal, viajas entre ciudades y pueblos usando varios métodos:
* Caminar: El método más común, especialmente al principio del juego.
* Ciclismo: Disponible una vez que obtengas una bicicleta en Cycling Road en Goldenrod City.
* Barco: Solía viajar entre ciertas ciudades, como desde New Bark Town hasta Violet City.
* Tren: Solía viajar a ciertas ciudades, como desde Goldenrod City hasta Ecruteak City. Usted compra boletos de tren para viajar, pero no hay un "pase de tren" exclusivo.
El juego no tiene un sistema de pases de tren como algunos juegos posteriores de Pokémon, como Pokémon Diamond, Pearl y Platinum.