A continuación se muestran algunas ejecuciones notables durante su reinado, todas llevadas a cabo por el estado:
* María, Reina de Escocia (1587): María era prima de Isabel y aspirante católica al trono inglés. Fue declarada culpable de traición y decapitada por su presunta participación en complots contra Isabel.
* El conde de Essex (1601): Favorito de Isabel, fue ejecutado por traición después de liderar una rebelión contra la reina.
Estos son sólo dos ejemplos, y muchos otros se enfrentaron a la ejecución por diversos delitos durante el reinado de Isabel. Si bien Isabel autorizó estas ejecuciones, no las llevó a cabo personalmente.