Temporada 1 (2007)
1. El niño que vivía
2. La Cámara de los Secretos (Parte 1)
3. La Cámara de los Secretos (Parte 2)
4. El prisionero de Azkaban
5. La copa del fuego (Parte 1)
6. La copa del fuego (Parte 2)
7. El orden del Phoenix (Parte 1)
8. El orden del Phoenix (Parte 2)
9. El Príncipe Malt-Blood
10. Las Reliquias de la Muerte (Parte 1)
11. Las Reliquias de la Muerte (Parte 2)
12. La piedra del hechicero
Temporada 2 (2008)
13. El coche volador
14. El gabinete de fuga
15. El torneo Triwizard
16. El Ministerio de Magia
17. La batalla de Hogwarts
18. Los Horcruxes
19. La profecía
20. Los Dursleys
21. The Weasley
22. Los Mortífagos
23. El orden del fénix
Temporada 3 (2009)
24. El Gran Salón
25. El bosque prohibido
26. La sala de requisitos
27. El espejo de Erised
28. La soplera dorada
29. El tiempo de tiempo
30. La capa de invisibilidad
31. El encanto de Patronus
32. La poción de Polyjuice
33. La Avada Kedavra Curse
Temporada 4 (2010)
34. The Hogwarts Express
35. El partido de quidditch
36. La pelota Yule
37. La defensa contra la clase de artes oscuras
38. La clase de herbología
39. La clase de pociones
40. La clase de encantos
41. La clase de transfiguración
42. La clase de astronomía
43. El cuidado de la clase de criaturas mágicas
Temporada 5 (2011)
44. La bola Yule (parte 2)
45. El Torneo Triwizard (Parte 2)
46. La Batalla de Hogwarts (Parte 2)
47. Los Horcruxes (Parte 2)
48. La profecía (Parte 2)
49. Los Dursley (parte 2)
50. The Weasley (Parte 2)
51. Los Mortífagos (Parte 2)
52. El orden del Phoenix (Parte 3)
Si bien el programa ya no está oficialmente en producción, el creador Neil Cicierega ha lanzado ocasionalmente nuevos videos de Potter Puppet Pals, a menudo como únicos o eventos especiales.