En esta serie, el personaje principal, Mikey Kudo, y sus amigos son transportados al mundo digital y se unen a sus socios Digimon. Sin embargo, en lugar de transformarse directamente, se "fusionan" con sus Digimon, lo que da como resultado una forma híbrida humano-Digimon llamada "Fusion Fighters". Esto les permite utilizar las habilidades de los Digimon y luchar junto a ellos.
La serie explora los temas de la amistad, el trabajo en equipo y la superación de desafíos mientras navega por los peligros del mundo digital.