Séguy nació en Toulon, Francia, el 1 de julio de 1877. Mostró pasión por la historia natural desde muy joven y comenzó a coleccionar insectos a los 12 años. Estudió medicina en la Universidad de Montpellier y se graduó en 1902.
Séguy comenzó su carrera como médico militar, pero pronto se dedicó a la entomología. Trabajó en el Museo Nacional de Historia Natural de París desde 1906 hasta su jubilación en 1942. Durante su estancia en el museo, fue curador de la colección de Dípteros y publicó numerosos artículos científicos y libros sobre el tema.
El principal área de investigación de Séguy fue la familia Muscidae, y se convirtió en un experto mundial en este grupo. Describió más de 1.000 nuevas especies de Muscidae y publicó varias monografías y catálogos sobre la familia. También trabajó en otras familias de Diptera, incluidas Tephritidae, Conopidae y Cecidomyiidae.
Además de su trabajo científico, Séguy también fue miembro activo de varias sociedades científicas, incluida la Société entomologique de France y la Royal Entomological Society de Londres. Fue galardonado con la Medalla Linneana de la Sociedad Linneana de Londres en 1939 y el Premio Constante de la Academia de Ciencias de París en 1949.
Séguy murió en París el 23 de octubre de 1951, a la edad de 74 años. Fue un entomólogo prolífico que hizo importantes contribuciones al estudio de los dípteros y su trabajo sigue siendo ampliamente citado por los científicos en la actualidad.