Novelas:
- La gran U (1984)
- Zodíaco (1988)
- Choque de nieve (1992)
- La era del diamante (1995)
- Criptonomicón (1999)
- El Ciclo Barroco (2003-2004):
-- mercurio
-- La confusión
-- El sistema del mundo
- Anatema (2008)
- Reamde (2011)
- Siete años (2015)
- Caer; o Esquivar en el infierno (2019)
- Choque de terminación (2021)
Colecciones de cuentos:
- El Muro de América (1999)
- Algunas observaciones:Cortometrajes de no ficción recopilados (2019)
Libros de ensayo y no ficción:
- En el Reino de Mao:Un viaje a la última utopía socialista (1999)
- Telaraña:una celebración de la interconexión de la vida en la Tierra (2011)