Libros :
- Hacer historia:un manual de investigación histórica (2001)
- Una breve historia del pensamiento católico (2002)
- Protestantismo:una introducción muy breve (2006)
- Cómo leer a los Padres de la Iglesia (2010)
- La esencia del cristianismo (2012)
- Filosofía:una breve historia (2014)
- La visión cristiana de la naturaleza humana (2016)
- La filosofía de la religión:un libro de texto (2017)
- El manual de Oxford de estudios cristianos primitivos (2019, editado con Hugh Denard)
- El Espíritu de la Reforma (2021)
Artículos y contribuciones :
- "El papel de la Iglesia en el humanismo cristiano" en The Cambridge Companion to Christian Humanism (2009)
- "El pensamiento católico y el mundo moderno" en The Wiley-Blackwell Companion to Catholicism (2010)
- "El desarrollo de la ley natural en el pensamiento cristiano" en The Oxford Handbook of Natural Law (2011)
- "Tomás de Aquino sobre la fe y la razón" en The Stanford Encyclopedia of Philosophy (2014)
- "El legado de los escolásticos" en The Routledge Companion to the History of Philosophy (2015)
Además de sus libros, Troeger ha contribuido con artículos y capítulos en varias revistas académicas y ha editado volúmenes, explorando la historia del cristianismo, temas teológicos y la intersección de la filosofía y la religión.