La guerra comienza cuando Portgas D. Ace, el comandante de la segunda división de los Piratas de Barbablanca e hijo biológico de Gol D. Roger, el ex Rey Pirata, es capturado por los Marines y programado para su ejecución. El hermano de Ace, Monkey D. Luffy, el protagonista de la serie, y su tripulación, los Piratas de Sombrero de Paja, intentan rescatar a Ace, lo que lleva a un enfrentamiento con los Marines.
A medida que la batalla se intensifica, se involucran individuos y grupos más poderosos, incluidos los tres Almirantes de la Infantería de Marina, los Siete Señores de la Guerra del Mar e incluso antiguos enemigos de los Piratas de Barbablanca que eligen luchar junto a ellos. La batalla está marcada por intensos combates, traiciones y sacrificios personales, ya que ambos bandos sufren numerosas bajas.
La Guerra Paramount tiene varias consecuencias importantes para el mundo de One Piece. Cambia el equilibrio de poder entre los marines y las tripulaciones piratas, lo que lleva a una nueva era de piratería. También revela información importante sobre la historia y los secretos del universo One Piece, incluida la verdadera naturaleza de las Frutas del Diablo y la existencia de las Armas Antiguas.
En general, la Guerra Paramount es un evento fundamental en la historia de One Piece que da forma al futuro de la serie y tiene repercusiones duraderas en los personajes y el mundo que habitan.