1. Desafía la Liga Pokémon y lucha hasta llegar al Campeón. Si derrotas al Campeón, recibirás una Master Ball como premio.
2. Intercambia 200 puntos de batalla por una Master Ball. Esto se puede hacer en el Intercambio de puntos de batalla ubicado en los Centros Pokémon en Ciudad Castelia, Ciudad Driftveil y Pueblo Lentimas.
3. Encuentra Master Balls como elementos ocultos. Las Master Balls a veces se pueden encontrar escondidas en el supramundo, como en un árbol o en una roca. También puedes encontrar Master Balls en algunos nidos de Pokémon, a los que solo se puede acceder mediante el uso de Hidden Machines Rock Smash o Cut.
4. Recibe Master Balls como regalo. A veces, puedes recibir una Master Ball como regalo de un personaje no jugador (NPC). Por ejemplo, puedes recibir una Master Ball del alcalde de la ciudad de Nimbasa después de completar ciertas misiones.