- BWV 147 "Corazón, Boca, Padre y Vida"
- BWV 140 "Cuidado, huele nuestra voz"
- BWV 198 "Lento primero, lento todavía un paso"
Oratorios de la pasión:
- Pasión según San Mateo, BWV 244
- Pasión según San Juan, BWV 245
Misas:
- Misa en si menor, BWV
- Misa en sol menor, BWV
Oratorios:
- Oratorio Pascual, BWV 249
- Oratorio de Navidad, BWV 248
Suites orquestales:
- Suite Orquestal No. 1 en do mayor, BWV
- Suite Orquestal No. 2 en si menor, BWV
- Suite Orquestal No. 3 en re mayor, BWV
- Suite Orquestal No. 4 en re mayor, BWV
Sonatas y partes para violín solo:
- Número de pieza. 1 en si menor, BWV
- Número de pieza. 2 en re menor, BWV
- Número de pieza. 3 en mi mayor, BWV
Sonatas y partes para violonchelo solo:
- Suite para violonchelo núm. 1 en sol mayor, BWV
- Suite para violonchelo núm. 2 en re menor, BWV
- Suite para violonchelo núm. 3 en do mayor, BWV
- Suite para violonchelo núm. 4 en mi bemol mayor, BWV
- Suite para violonchelo núm. 5 en do menor, BWV
- Suite para violonchelo núm. 6 en re mayor, BWV
Conciertos:
- Concierto de Brandeburgo núm. 1 en fa mayor, BWV
- Concierto de Brandeburgo núm. 2 en fa mayor, BWV
- Concierto de Brandeburgo núm. 3 en sol mayor, BWV
- Concierto de Brandeburgo núm. 4 en sol mayor, BWV
- Concierto de Brandeburgo núm. 5 en re mayor, BWV
- Concierto de Brandeburgo núm. 6 en si bemol mayor, BWV
El teclado funciona:
- El clave bien temperado, libros 1 y 2, BWV 846-8
- Las Variaciones Goldberg, BWV 988
- Suites francesas, BWV 812-817
- Suites inglesas, BWV 806-811
- Piezas, BWV 825-830
Otros trabajos:
- La oferta musical, BWV 1079
- El arte de la fuga, BWV
- Coros, BWV 250-438