A lo largo de la canción, Vedder reflexiona sobre su relación con su madre, expresando sentimientos de culpa y arrepentimiento. Contempla la idea de "aferrarse" a su memoria y al impacto que su muerte ha dejado en su vida. La letra también toca temas de redención y la búsqueda de guía espiritual en tiempos de dolor.
La canción también es una reflexión sobre las emociones complejas que conlleva la pérdida de un padre, incluida la ira, la tristeza y el anhelo por el pasado. El coro enfatiza la idea del perdón y la búsqueda de la paz, mientras Vedder canta:"Soy un hombre afortunado de contar con ambas manos a los que amo".
"Daughter" es una canción profundamente personal y conmovedora que habla de la experiencia universal de la pérdida y el dolor. Sirve como recordatorio del profundo impacto que la muerte de un ser querido puede tener en nuestras vidas y nos anima a encontrar consuelo en los recuerdos que apreciamos.