Televisión:
* El Novato (2018 - presente): Sargento "Nyla" Harper
* El alambre (2002-2008): Detective "Beadie" Russell
* Seis pies bajo tierra (2001-2005): Brenda Chenowith
* ER (1994-2009): Dra. Janet Coburn
* Expediente X (1993-2018): Dra. Anne Hebilla
* El ala oeste (1999-2006): Dra. Grace Barnett
* La buena esposa (2009-2016): Juez Christine "Chrissy" Sexton
* Castillo (2009-2016): Detective Ryan "Ritter" Russell
* Ley y Orden:Unidad de Víctimas Especiales (1999-presente): Varios roles
* Anatomía de Grey (2005-presente): Dra. Beth Hunter
* NCIS (2003-presente): Dra. Wendy Kieffer
* Mentes criminales (2005-2020): Dra. Erica Rinehart
* Familia Moderna (2009-2020): enfermera pam
Película:
* La hermandad de los pantalones de viaje (2005): señora oro
* La partitura perfecta (2004): señora panadero
* Pasado mañana (2004): Dra. Lucy Hall
* El Príncipe de las Mareas (1991): Marta McMahon
* Thelma y Louise (1991): carhop
* El silencio de los corderos (1991): Mujer en la gasolinera
* El jugador (1992): secretaria
Esta es sólo una lista parcial, ya que Amy Aquino ha estado en muchos otros proyectos a lo largo de su carrera. Es una actriz polifacética con fuerte presencia tanto en la pantalla grande como en la pequeña.