* Plantación de Nueva Inglaterra (1630)
* La causa de Dios y su pueblo en Nueva Inglaterra (1663)
* El deplorable estado de Nueva Inglaterra (1662)
* Las obras de John Higginson (2 vols., 1971-1973)
Sermones
* Un sermón de despedida (1663)
* Un sermón predicado durante la ordenación del Sr. Samuel Willard (1670)
* Un sermón predicado en la ordenación del Sr. Aumentar Mather (1684)
* Un sermón predicado en la ordenación del Sr. Cotton Mather (1685)
Otros escritos
* Una carta a la Iglesia de Cristo en Charlestown (1669)
* Una respuesta a la respuesta de los ancianos de las iglesias de Nueva Inglaterra (1664)
* Una reivindicación de las iglesias de Nueva Inglaterra (1669)