Películas:
* La Bella de Rosa (1986) :Esta comedia romántica para adolescentes es posiblemente su papel más famoso.
* Superman IV:En busca de la paz (1987) :Interpretó el papel de Lenny Luthor, el hijo de Lex Luthor.
* Los tres mosqueteros (1993) :Una versión cómica de la historia clásica en la que interpretó a Planchet.
* ¡Tiros calientes! (1991) y ¡Tiros calientes! Parte dos (1993) :Dos películas de parodia protagonizadas por Charlie Sheen, donde Cryer desempeñó un papel secundario.
* Dos tontos muy tontos (1994) :Un papel pequeño pero memorable como camarero.
* Sólo de visita (2001) :Una comedia franco-estadounidense donde Cryer interpreta a un caballero medieval.
* El problema de los hombres (2010) :Una comedia romántica con un reparto repleto de estrellas.
* Sicario (2012) :Un thriller sobre un sicario que tiene la tarea de matar a un senador estadounidense.
Televisión:
* El famoso Teddy Z (1989-1990) :Su primer papel protagónico en una comedia televisiva.
* El problema con Larry (1993-1994) :Una comedia de situación de corta duración en la que Cryer interpretó al personaje principal.
* Socios (2011-2012) :Coprotagonizó con Michael Urie esta comedia sobre una sociedad entre dos abogados.
* Dos hombres y medio (2003-2015) :El papel destacado de Cryer como el personaje de Alan Harper, que le valió cuatro premios Primetime Emmy al mejor actor de reparto en una serie de comedia.
* Mamá (2013-2021) :Se unió al elenco de esta comedia en la temporada 4, interpretando el papel de Adam, el interés amoroso de Christy (interpretada por Anna Faris).
* El padrino de Harlem (2019-presente) :Cryer interpreta el papel del alcalde Robert Wagner, el corrupto alcalde de la ciudad de Nueva York durante la era del jefe criminal, Bumpy Johnson.
Esta es sólo una selección de sus proyectos más destacados. Jon Cryer ha estado involucrado en muchos otros proyectos cinematográficos y televisivos a lo largo de su carrera. Es un actor versátil y talentoso que ha demostrado ser capaz de interpretar papeles tanto cómicos como dramáticos.